Gnomeのアプリケーションメニューが空になってしまった

2週間くらい放置していたが不便なので調べた。
アプリケーションメニューは
~/.config/menus/applications.menu
を参照していて中身は下のようなxml

<!DOCTYPE Menu
  PUBLIC '-//freedesktop//DTD Menu 1.0//EN'
  'http://standards.freedesktop.org/menu-spec/menu-1.0.dtd'>
<Menu>
	<Name>Applications</Name>
	<MergeFile type="parent">/etc/xdg/menus/applications.menu</MergeFile>
</Menu>

結局
/etc/xdg/menus/applications.menu
を参照しているのだが、このファイルが無かった。

# cd /etc/xdg/menus
# ln -s gnome-applications.menu applications.menu

としたら直ったっぽい。
どれかパッケージのインストールに失敗しているのか。